단백질 구조 예측 AI인 AlphaFold3(AF3)는 혁신적인 도구이지만, 거대 핵산 복합체(Nucleoprotein) 시뮬레이션에서는 여전히 미세한 기하학적 오류를 남깁니다. 본 리포트에서는 유전자 가위로 잘 알려진 4UN3(Cas9-sgRNA-DNA 복합체)를 대상으로 HanjariFold ZENITH 엔진이 달성한 물리적 정제 성과를 팩트 중심으로 요약합니다. 1. 주요 지표 비교: AF3 원본 vs HanjariFold ZENITH 가장 객관적인 구조 검증 지표인 MolProbity 분석 결과, HanjariFold는 거대 복합체의 […]
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단백질 구조 모델링 분야는 2024년 말 알파폴드(AlphaFold)의 노벨 화학상 수상을 기점으로 단순한 학술적 연구의 영역을 넘어 현대 생명공학 및 제약 산업의 핵심 인프라로 완전히 자리 잡았다. 2025년과 2026년 사이의 기술적 지형은 단일 단백질의 접힘 구조 예측을 넘어 단백질과 리간드, 핵산, 이온 간의 복합체 상호작용을 통합적으로 모델링하는 ‘멀티모달 파운데이션 모델(Multimodal Foundation Models)’의 시대로 진입했다. 이러한 변화는 […]
화학의 유용성 (1) 화학의 발전 과정 ① 불의 발견과 이용：금속의 제련이 가능해졌다. ② 중세와 근대 연금술의 발전：화학적 조작 및 새로운 화학 물질을 발견하는 계기가 되었다. ③ 18세기 말 라부아지에의 화학 혁명：물질이 산소와 반응하여 연소된다는 사실이 밝혀져 화학이 크게 발전하는 원동력이 되었다. (2) 화학과 식량 문제의 해결 ① 식량 문제：산업 혁명 이후 인구의 급격한 증가로 인해 […]
DNA 미세배열은 RNA 발현 패턴과 그 외 다른 정보를 제공한다. (레닌저)생화학 제6판, p337 DNA 라이브러리, PCR 기술 및 부합화 기술이 함께 어우러져서 고안된 기술이 DNA 미세배열이다. 이기술을 이용하면 수천개의 유전자를 속히 동시에 가려낼 수 있다. 길이 상으로는 수십에서 수백여 개의 뉴클레오타이드로 구성된 알려진 유전자의 DNA 조각을 PCR에 의하여 증폭하고, 나노 리터 정도의 적은 양의 […]
생명체를 구성하는 물질생명체를 구성하는 원소를 약 30여 종으로 지각의 구성 원소와 비슷하나, 구성 비율은 다르다.(1) 지각과 생명체의 구성 원소 비교 ◈ 탄소 화합물탄소는 크고 복잡하며 다양한 분자를 형성할 수 있는 능력이 있어서 지구상에 존재하는 생물들의 다양성을 가능하게 한다. 탄수화물, 지질, 단백질, 핵산은 탄소 화합물이며 탄소에 수소(H), 산소(O), 황(S), 인(P) 등이 결합한 물질들이다. (1) 탄수화물: […]
바이러스의 구조 (1) 유전 물질인 핵산(DNA 또는 RNA)이 단백질 껍질에 싸여 있는 구조이다. (2) 종류에 따라 다양한 형태를 띠고 있으며 세균보다 크기가 작아 세균 여과기를 통과한다. 바이러스의 특성 (1) 바이러스는 일부 생물적 특성이 있지만 비생물적 특성도 있다. 비생물적 특성 – 세포막, 리보솜과 같은 세포 소기관이 없어 세포의 구조를 갖추지 못한 상태이다.– 독자적인 효소가 없어 […]